La société a été fondée à Saint-Imier, en Suisse, en 1860 par Edouard Heuer, qui avait alors 20 ans. La précision et la durabilité des modèles fabriqués dans des matériaux performants et dotés de mouvements mécaniques d'avant-garde deviennent immédiatement le fondement de la marque. Heuer va s'imposer dans l'industrie de la chronométrie, notamment la chronométrie automobile.